La Secretaría de Organización tiene como principal objetivo la coordinación de las distintas agrupaciones que conforman la Federación Socialista Asturiana, en su vertiente orgánica. Lleva el control de la afiliación y la preparación de los congresos del partido.
Esta Secretaría también define la acción electoral, tanto en el interior como en el exterior.
Por último, está encargada de dirigir la disciplina interna y vigilar el cumplimiento de los estatutos.